蚊蟲呼吸主要透過氣管系統，本研究假設底層孑孓與搖蚊幼蟲具備類似血紅蛋白系統以擷取氧氣。於戶外採集8種孑孓和1類搖蚊幼蟲，室內錄影觀察發現孑孓和搖蚊幼蟲於水中停棲有明顯分層：竹生翠蚊、白腹叢蚊和搖蚊幼蟲長時間停留底層；家蚊、斑蚊則反覆上下至水面呼吸。經量測呼吸管、氣管和氣泡等變因，發現其與孑孓在水中分布差異不顯著，惟閉氣與氣管長度具顯著相關。顯微鏡觀察發現白腹叢蚊幼蟲外殼內側充滿紅點，且色澤隨著富氧或缺氧變化；然二種斑蚊則不明顯。進一步設計多組引子，成功增幅6種蚊幼蟲和1類搖蚊血紅蛋白基因。以即時定量RT-PCR分析RNA之表現，顯示底棲性白腹叢蚊與鹽埕搖蚊在缺氧條件下，血紅蛋白基因相對表現倍數分別增加5倍和150倍，埃及斑蚊表現量降低，白線斑蚊則差異不顯著。本研究建立蚊蟲血紅蛋白基因，並解釋蚊蟲生態分布特性。